Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms