Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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