Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms