Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms