Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col19a1Q0VF58 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col19a1Q0VF58 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col19a1Q0VF58 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Col19a1Q0VF58 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col19a1Q0VF58 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms