Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms