Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rundc1Q0VDN7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms