Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam83bQ0VBM2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms