Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.1 ms