Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms