Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms