Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms