Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms