Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms