Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Col17a1Q07563 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms