Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms