Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms