Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms