Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf4Q06507 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atf4Q06507 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atf4Q06507 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atf4Q06507 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atf4Q06507 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atf4Q06507 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Atf4Q06507 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atf4Q06507 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atf4Q06507 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atf4Q06507 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atf4Q06507 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Atf4Q06507 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atf4Q06507 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atf4Q06507 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atf4Q06507 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Atf4Q06507 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atf4Q06507 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atf4Q06507 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atf4Q06507 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atf4Q06507 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atf4Q06507 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atf4Q06507 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atf4Q06507 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atf4Q06507 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Atf4Q06507 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atf4Q06507 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atf4Q06507 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atf4Q06507 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atf4Q06507 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atf4Q06507 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atf4Q06507 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atf4Q06507 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atf4Q06507 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atf4Q06507 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atf4Q06507 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atf4Q06507 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atf4Q06507 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atf4Q06507 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atf4Q06507 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atf4Q06507 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Atf4Q06507 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atf4Q06507 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atf4Q06507 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atf4Q06507 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atf4Q06507 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atf4Q06507 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atf4Q06507 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atf4Q06507 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atf4Q06507 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atf4Q06507 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atf4Q06507 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atf4Q06507 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atf4Q06507 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atf4Q06507 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atf4Q06507 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atf4Q06507 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atf4Q06507 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atf4Q06507 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atf4Q06507 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Atf4Q06507 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Atf4Q06507 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Atf4Q06507 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atf4Q06507 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atf4Q06507 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atf4Q06507 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atf4Q06507 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atf4Q06507 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atf4Q06507 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atf4Q06507 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atf4Q06507 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atf4Q06507 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atf4Q06507 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atf4Q06507 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atf4Q06507 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atf4Q06507 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atf4Q06507 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atf4Q06507 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atf4Q06507 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atf4Q06507 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atf4Q06507 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atf4Q06507 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Atf4Q06507 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atf4Q06507 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atf4Q06507 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atf4Q06507 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atf4Q06507 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atf4Q06507 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atf4Q06507 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atf4Q06507 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atf4Q06507 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atf4Q06507 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atf4Q06507 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atf4Q06507 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atf4Q06507 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atf4Q06507 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atf4Q06507 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atf4Q06507 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atf4Q06507 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atf4Q06507 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms