Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms