Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Caprin2Q05A80 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms