Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms