Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fmn1Q05860 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms