Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a1Q05722 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms