Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms