Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms