Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms