Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pfdn6Q03958 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pfdn6Q03958 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pfdn6Q03958 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pfdn6Q03958 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pfdn6Q03958 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pfdn6Q03958 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pfdn6Q03958 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pfdn6Q03958 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pfdn6Q03958 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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