Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms