Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms