Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec23aQ01405 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms