Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms