Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HmgcrQ01237 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms