Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SelpQ01102 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelpQ01102 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelpQ01102 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SelpQ01102 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SelpQ01102 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SelpQ01102 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SelpQ01102 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms