Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms