Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms