Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp10Q000W5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms