Protein–RNA interactions for Protein: P97953

Vegfc, Vascular endothelial growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfcP97953 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfcP97953 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfcP97953 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfcP97953 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfcP97953 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfcP97953 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfcP97953 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfcP97953 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfcP97953 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms