Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AlkP97793 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AlkP97793 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AlkP97793 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AlkP97793 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AlkP97793 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AlkP97793 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AlkP97793 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AlkP97793 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AlkP97793 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AlkP97793 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AlkP97793 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AlkP97793 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AlkP97793 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AlkP97793 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AlkP97793 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AlkP97793 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AlkP97793 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AlkP97793 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AlkP97793 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AlkP97793 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AlkP97793 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AlkP97793 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AlkP97793 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AlkP97793 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AlkP97793 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AlkP97793 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AlkP97793 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AlkP97793 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AlkP97793 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
AlkP97793 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AlkP97793 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AlkP97793 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AlkP97793 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AlkP97793 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AlkP97793 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AlkP97793 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AlkP97793 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AlkP97793 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AlkP97793 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AlkP97793 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AlkP97793 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AlkP97793 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AlkP97793 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AlkP97793 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AlkP97793 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AlkP97793 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AlkP97793 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AlkP97793 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AlkP97793 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AlkP97793 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AlkP97793 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AlkP97793 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AlkP97793 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AlkP97793 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AlkP97793 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
AlkP97793 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
AlkP97793 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AlkP97793 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AlkP97793 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AlkP97793 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AlkP97793 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AlkP97793 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AlkP97793 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AlkP97793 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AlkP97793 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AlkP97793 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AlkP97793 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AlkP97793 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AlkP97793 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AlkP97793 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AlkP97793 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AlkP97793 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AlkP97793 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AlkP97793 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AlkP97793 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AlkP97793 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AlkP97793 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AlkP97793 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AlkP97793 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AlkP97793 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AlkP97793 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AlkP97793 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AlkP97793 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AlkP97793 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
AlkP97793 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AlkP97793 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AlkP97793 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AlkP97793 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AlkP97793 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AlkP97793 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AlkP97793 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AlkP97793 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AlkP97793 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AlkP97793 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AlkP97793 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AlkP97793 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AlkP97793 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AlkP97793 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AlkP97793 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms