Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psme1P97371 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Psme1P97371 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Psme1P97371 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Psme1P97371 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psme1P97371 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Psme1P97371 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psme1P97371 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psme1P97371 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psme1P97371 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psme1P97371 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psme1P97371 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psme1P97371 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psme1P97371 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psme1P97371 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psme1P97371 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psme1P97371 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psme1P97371 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psme1P97371 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psme1P97371 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psme1P97371 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psme1P97371 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psme1P97371 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psme1P97371 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psme1P97371 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Psme1P97371 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psme1P97371 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psme1P97371 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psme1P97371 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psme1P97371 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psme1P97371 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psme1P97371 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Psme1P97371 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psme1P97371 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Psme1P97371 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Psme1P97371 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Psme1P97371 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Psme1P97371 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psme1P97371 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psme1P97371 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psme1P97371 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms