Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmsP97355 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmsP97355 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmsP97355 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmsP97355 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmsP97355 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmsP97355 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmsP97355 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmsP97355 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmsP97355 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmsP97355 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmsP97355 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmsP97355 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmsP97355 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmsP97355 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmsP97355 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmsP97355 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmsP97355 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmsP97355 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmsP97355 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmsP97355 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmsP97355 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmsP97355 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmsP97355 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SmsP97355 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmsP97355 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmsP97355 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmsP97355 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmsP97355 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmsP97355 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmsP97355 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmsP97355 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmsP97355 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmsP97355 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmsP97355 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SmsP97355 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmsP97355 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmsP97355 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmsP97355 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmsP97355 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmsP97355 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmsP97355 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmsP97355 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SmsP97355 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SmsP97355 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SmsP97355 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SmsP97355 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SmsP97355 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SmsP97355 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmsP97355 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SmsP97355 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmsP97355 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmsP97355 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SmsP97355 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms