Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms