Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tp53bp1P70399 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms