Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms