Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx3P70354 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx3P70354 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx3P70354 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx3P70354 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx3P70354 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx3P70354 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx3P70354 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx3P70354 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx3P70354 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx3P70354 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx3P70354 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms