Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad1P70340 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad1P70340 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad1P70340 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms