Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgif1P70284 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgif1P70284 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgif1P70284 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgif1P70284 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgif1P70284 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgif1P70284 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgif1P70284 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgif1P70284 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgif1P70284 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgif1P70284 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgif1P70284 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgif1P70284 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgif1P70284 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgif1P70284 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgif1P70284 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgif1P70284 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tgif1P70284 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgif1P70284 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tgif1P70284 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgif1P70284 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgif1P70284 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgif1P70284 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgif1P70284 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgif1P70284 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgif1P70284 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgif1P70284 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgif1P70284 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tgif1P70284 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tgif1P70284 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tgif1P70284 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tgif1P70284 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tgif1P70284 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tgif1P70284 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tgif1P70284 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgif1P70284 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tgif1P70284 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tgif1P70284 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgif1P70284 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tgif1P70284 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tgif1P70284 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgif1P70284 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tgif1P70284 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgif1P70284 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgif1P70284 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgif1P70284 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgif1P70284 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgif1P70284 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgif1P70284 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgif1P70284 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgif1P70284 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgif1P70284 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgif1P70284 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgif1P70284 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tgif1P70284 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgif1P70284 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgif1P70284 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tgif1P70284 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgif1P70284 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgif1P70284 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgif1P70284 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgif1P70284 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgif1P70284 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgif1P70284 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgif1P70284 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgif1P70284 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgif1P70284 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgif1P70284 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgif1P70284 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgif1P70284 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgif1P70284 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgif1P70284 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tgif1P70284 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tgif1P70284 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tgif1P70284 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgif1P70284 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgif1P70284 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgif1P70284 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tgif1P70284 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgif1P70284 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgif1P70284 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgif1P70284 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgif1P70284 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgif1P70284 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgif1P70284 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgif1P70284 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgif1P70284 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgif1P70284 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgif1P70284 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgif1P70284 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgif1P70284 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgif1P70284 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgif1P70284 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgif1P70284 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgif1P70284 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgif1P70284 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgif1P70284 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgif1P70284 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgif1P70284 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgif1P70284 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms