Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms