Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfixP70257 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfixP70257 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfixP70257 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NfixP70257 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NfixP70257 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfixP70257 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfixP70257 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfixP70257 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfixP70257 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfixP70257 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfixP70257 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfixP70257 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfixP70257 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfixP70257 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfixP70257 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfixP70257 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfixP70257 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NfixP70257 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NfixP70257 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfixP70257 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfixP70257 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfixP70257 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfixP70257 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfixP70257 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfixP70257 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfixP70257 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfixP70257 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NfixP70257 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfixP70257 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfixP70257 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfixP70257 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfixP70257 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NfixP70257 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NfixP70257 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfixP70257 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfixP70257 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfixP70257 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfixP70257 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfixP70257 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfixP70257 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfixP70257 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfixP70257 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
NfixP70257 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NfixP70257 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NfixP70257 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NfixP70257 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NfixP70257 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NfixP70257 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NfixP70257 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NfixP70257 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NfixP70257 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NfixP70257 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NfixP70257 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NfixP70257 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NfixP70257 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NfixP70257 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NfixP70257 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NfixP70257 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NfixP70257 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NfixP70257 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NfixP70257 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NfixP70257 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NfixP70257 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NfixP70257 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfixP70257 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfixP70257 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfixP70257 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfixP70257 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfixP70257 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfixP70257 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfixP70257 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfixP70257 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfixP70257 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NfixP70257 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfixP70257 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfixP70257 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NfixP70257 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfixP70257 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfixP70257 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfixP70257 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfixP70257 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfixP70257 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfixP70257 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfixP70257 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfixP70257 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfixP70257 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfixP70257 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NfixP70257 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NfixP70257 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NfixP70257 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NfixP70257 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NfixP70257 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NfixP70257 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NfixP70257 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NfixP70257 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NfixP70257 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NfixP70257 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NfixP70257 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NfixP70257 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms