Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms